Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPR88Q9GZN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms