Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR12Q9C0I1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms