Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRCC1Q9C099 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRCC1Q9C099 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms