Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXQ1Q9C009 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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