Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKD2Q9BZL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD2Q9BZL6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms