Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIH1Q9BYX4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIH1Q9BYX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms