Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAIPQ9BWF2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAIPQ9BWF2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms