Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC2P3Q9BVR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms