Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf16Q9BUW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms