Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTA3Q9BTC8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTA3Q9BTC8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms