Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM175Q9BSA9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms