Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP44Q9BS26 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERP44Q9BS26 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms