Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LARP6Q9BRS8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP6Q9BRS8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms