Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF559Q9BR84 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF559Q9BR84 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms