Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHDC3Q9BQ90 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms