Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP2Q99959 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms