Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRX2Q99811 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRX2Q99811 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms