Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS3Q99687 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms