Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGRRF1Q99675 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGRRF1Q99675 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms