Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHP1Q99653 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms