Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms