Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP1Q99575 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POP1Q99575 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP1Q99575 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP1Q99575 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP1Q99575 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP1Q99575 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP1Q99575 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP1Q99575 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POP1Q99575 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POP1Q99575 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POP1Q99575 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP1Q99575 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP1Q99575 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP1Q99575 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP1Q99575 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP1Q99575 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP1Q99575 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POP1Q99575 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP1Q99575 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP1Q99575 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP1Q99575 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP1Q99575 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POP1Q99575 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP1Q99575 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP1Q99575 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP1Q99575 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP1Q99575 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP1Q99575 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP1Q99575 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP1Q99575 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms