Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP19Q99542 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP19Q99542 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP19Q99542 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms