Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A12Q96S37 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A12Q96S37 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A12Q96S37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A12Q96S37 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms