Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRAM1Q96QH2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRAM1Q96QH2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAM1Q96QH2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms