Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP47Q96K76 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP47Q96K76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP47Q96K76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP47Q96K76 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms