Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22AQ96IW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms