Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED3Q96IU2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED3Q96IU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED3Q96IU2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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