Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTV1Q96GA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms