Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms