Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC3Q96F86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDC3Q96F86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms