Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FBXO17Q96EF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXO17Q96EF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms