Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms