Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A6EQ96DS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms