Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC58Q96CX6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC58Q96CX6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC58Q96CX6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC58Q96CX6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms