Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTHRC1Q96CG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTHRC1Q96CG8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms