Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC127Q96BQ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms