Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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GTF3C6Q969F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
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GTF3C6Q969F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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