Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TNRQ92752 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNRQ92752 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNRQ92752 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNRQ92752 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNRQ92752 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNRQ92752 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNRQ92752 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNRQ92752 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNRQ92752 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNRQ92752 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNRQ92752 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNRQ92752 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRQ92752 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TNRQ92752 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNRQ92752 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNRQ92752 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNRQ92752 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNRQ92752 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRQ92752 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRQ92752 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRQ92752 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRQ92752 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRQ92752 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRQ92752 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRQ92752 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRQ92752 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRQ92752 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNRQ92752 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNRQ92752 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNRQ92752 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNRQ92752 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRQ92752 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRQ92752 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRQ92752 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRQ92752 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRQ92752 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRQ92752 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms