Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC12Q8WVT3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC12Q8WVT3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms