Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAP25Q8TEE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAP25Q8TEE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAP25Q8TEE9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms