Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC44.74■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms