Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRSK1Q8TDC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRSK1Q8TDC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms