Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL4L1Q8NHW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL4L1Q8NHW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms