Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms