Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND6BQ8NEG7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms