Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF248Q8NDW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF248Q8NDW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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