Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC17Q8N6Y2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRC17Q8N6Y2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms