Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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CLDN19Q8N6F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN19Q8N6F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN19Q8N6F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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