Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPICE1Q8N0Z3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPICE1Q8N0Z3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPICE1Q8N0Z3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms